1. как разметить: для GPT есть утиль parted
viewtopic.php?f=41&t=3240&p=76671&hilit=parted#p76671
и да рекомендую разметить именно под линухом, в венде GPT не очень любят и иногда портят таблицу разделов.
далее форматирование и перемонтирование как обычно! никогда проблем не было с GPT