Все что я перечислил - это малая йота всех нюансов которые всплывут в процессе, а не вопросы к вам. Отвечать на это вообще не стоило. О чем я по сути и сказал.
Ваше предложение выглядит крайне субъективно и заточено под исключительно ваши нужды и вашу организацию файлов (я например все качаю в одну папку, потом перемещаю оттуда в другое место, если планирую долго хранить, а обычно посмотрел и удаляю), не считаясь с теми кому нужна, например музыка а не фильмы, с теми кто смотрит фильмы с субтитрами, другим переводом и т.п.
Ну и учитывая что вы самостоятельно для себя все это уже сделали - какой смысл делать заново, а потом полгода допиливать учитывая хотелки каждого пользователя? Кидайте свой скрипт в rc.init, ставьте интервал повтора и пользуйтесь.
P.s. Если файлы на винте предназначены для длительного хранения - имхо проще и правильнее создать папки музыка, сериалы, фильмы отдельно от папки закачек и потом распределить все красиво и по полочкам. Тогда в папке закачек как раз все новое и будет.